京都大學現(xiàn)共有10個學部，分別是：
綜合人知學部：含人類科學系、國際文明學系、文化環(huán)境學系、認知情報學系、自然科學系；
文學部：含人文學科；
教育學部：含教育學、社會學、心理學3系，共14個講座；
法學部：僅有法律學一個系，含公法、民刑法、基礎法學及政治學4科，共39個講座。附屬圖書館中設國際政治法律文獻中心；
經(jīng)濟學部：含經(jīng)濟學、經(jīng)營學2系，共11個講座；
理學部：該學部幾乎包括自然科學各個領域，包括數(shù)、理、化、生、宇宙、地球科學等9個系，共70個講座。各系既相互獨立又相互交叉。設施有兩個天文臺，8個火山、地震、氣候、天體學等方面的觀測所，4個海洋實驗所，一個植物園等；
醫(yī)學部：含有基礎和臨床兩大分部的若干系科，共有39個講座。附屬機構有校醫(yī)院、腦神經(jīng)研究、免疫學研究設施、人體先天異常標本中心、綜合解剖中心、動物實驗設施等；
工學部：學部含24個系，168個講座。研究領域涉及冶金、電氣、自動化、航空、機械、原子能、土木建筑、化工、交通、信息工程等。附屬機構有離子工程、自動化研究所、環(huán)境微量污染防治、重質炭資源轉換等工程研究設施；
藥學部：含藥學、制藥化學兩系，共13個講座，附設藥用植物園；
農(nóng)學部：含10個系，53個講座，并有附屬農(nóng)場、林場、牧場、及供農(nóng)學研究、亞熱帶作物、水產(chǎn)、細胞培養(yǎng)、農(nóng)業(yè)會計等方面進行研究的設施等。
